PubChem-Rohdaten mit rsync herunterladen

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PubChem-Rohdaten werden auf den NCBI-Servern gehostet, die bequemen Zugriff über rsync bieten.

Laden Sie PubChem-Daten mit einem rsync-Befehl wie diesem herunter:

download_pubchem_rsync.sh
rsync -Pav ftp.ncbi.nlm.nih.gov::pubchem/Compound/CURRENT-Full/SDF/\*.gz pubchem/

Dieser Beispielbefehl lädt alle aktuellen Verbindungen im SDF-Format herunter.

Sie können die PubChem-Verzeichnisstruktur erkunden, indem Sie mit Ihrem Browser auf den NCBI-FTP-Server zugreifen.


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