Необработанные данные PubChem размещены на серверах NCBI, которые предоставляют удобный доступ с помощью rsync.
Скачайте данные PubChem с помощью команды rsync вроде
download_pubchem_rsync.sh
rsync -Pav ftp.ncbi.nlm.nih.gov::pubchem/Compound/CURRENT-Full/SDF/\*.gz pubchem/Эта примерная команда скачает все текущие соединения в формате SDF.
Вы можете изучить структуру директорий PubChem, получив доступ к FTP-серверу NCBI через ваш браузер.
Check out similar posts by category:
Биоинформатика
If this post helped you, please consider buying me a coffee or donating via PayPal to support research & publishing of new posts on TechOverflow