Скачивание необработанных данных PubChem с помощью rsync

Необработанные данные PubChem размещены на серверах NCBI, которые предоставляют удобный доступ с помощью rsync.

Скачайте данные PubChem с помощью команды rsync вроде

download_pubchem_rsync.sh
rsync -Pav ftp.ncbi.nlm.nih.gov::pubchem/Compound/CURRENT-Full/SDF/\*.gz pubchem/

Эта примерная команда скачает все текущие соединения в формате SDF.

Вы можете изучить структуру директорий PubChem, получив доступ к FTP-серверу NCBI через ваш браузер.


Check out similar posts by category: Биоинформатика