Як виправити помилку встановлення RcppGSL: gsl-config: Command not found

Проблема:

При спробі встановити RcppGSL за допомогою

install_rcppgsl.R

BiocManager::install("RcppGSL")

BiocManager::install("RcppGSL")

ви бачите наступне повідомлення про помилку:

gsl_config_error.txt

checking for gcc option to accept ISO C89... none needed
checking for gsl-config... no
configure: error: gsl-config not found, is GSL installed?
ERROR: configuration failed for package ‘RcppGSL’
* removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/RcppGSL’

The downloaded source packages are in
        ‘/tmp/RtmpqSzFab/downloaded_packages’
Warning message:
In .inet_warning(msg) :
  installation of package ‘RcppGSL’ had non-zero exit status

checking for gcc option to accept ISO C89... none needed
checking for gsl-config... no
configure: error: gsl-config not found, is GSL installed?
ERROR: configuration failed for package ‘RcppGSL’
* removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/RcppGSL’

The downloaded source packages are in
        ‘/tmp/RtmpqSzFab/downloaded_packages’
Warning message:
In .inet_warning(msg) :
  installation of package ‘RcppGSL’ had non-zero exit status

Рішення

Вам потрібно встановити заголовні файли для розробників libgsl2, які включають виконуваний файл gsl-config.

На Ubuntu ви можете встановити це за допомогою

install_gsl_deps.sh

sudo apt -y install libgsl2-dev

sudo apt -y install libgsl2-dev