使用 rsync 下载 PubChem 原始数据

PubChem 原始数据托管在 NCBI 服务器上,提供使用 rsync便捷访问

使用类似这样的 rsync 命令下载 PubChem 数据

download_pubchem_rsync.sh
rsync -Pav ftp.ncbi.nlm.nih.gov::pubchem/Compound/CURRENT-Full/SDF/\*.gz pubchem/

此示例命令将以 SDF 格式下载所有当前化合物

你可以使用浏览器访问 NCBI FTP 服务器来浏览 PubChem 目录结构。


Check out similar posts by category: Bioinformatics