如何使用 rsync 下载 PubMed 基线数据

PubMed 原始数据托管在 NCBI 服务器上,提供使用 rsync便捷访问

使用类似这样的 rsync 命令下载 PubMed 基线数据

download_pubmed_rsync.sh
rsync -Pav ftp.ncbi.nlm.nih.gov::pubmed/baseline/\*.xml.gz Pubmed/

此示例命令将所有基线数据文件作为 .xml.gz 下载到 PubMed 文件夹

你可以使用浏览器访问 NCBI FTP 服务器来浏览 PMC 目录结构。


Check out similar posts by category: Bioinformatics