如何下载和同步 PubMed 基线 + 更新

在我们的上一篇文章如何使用 rsync 下载 PubMed 基线数据中,我们展示了如何更新 PubMed 的基线数据。此数据集仅每年更新 - 但是,你可以下载通常每天更新一次的更新文件

将两组文件下载并同步到 PubMed 目录的命令:

download_pubmed_rsync.sh
rsync -Pav --delete ftp.ncbi.nlm.nih.gov::pubmed/baseline/\*.xml.gz PubMed/
rsync -Pav --delete ftp.ncbi.nlm.nih.gov::pubmed/updatefiles/\*.xml.gz PubMed/

--delete 选项将确保服务器上删除的文件也会在本地删除。例如,当发布新的基线数据集时,你需要删除旧年份的文件以避免处理重复数据。


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